Radicale prostatectomie is technisch een delicate operatie die nogal wat vaardigheid vergt van de chirurg. De belangrijkste complicaties zijn erectiestoornissen (impotentie) en urineverlies (incontinentie).
Aan de twee kanten van de prostaat lopen zenuwen die essentieel zijn om een erectie te krijgen. De tumor kan dicht bij die zenuwen zitten. Afhankelijk van de kenmerken van de tumor kan de chirurg inschatten of hij één of beide zenuwen kan sparen. Bij jonge patiënten die aan de twee zijden zenuwsparend geopereerd worden, krijgen de meeste mannen hun potentie na enige tijd terug. Worden de zenuwen aan de twee kanten verwijderd, dan is de patiënt meteen na de operatie impotent. Er is ook een kans op urineverlies na de ingreep. Het risico op die problemen neemt toe naarmate de patiënt ouder is. Het is belangrijk te beseffen dat er voor die complicaties oplossingen zijn met vaak een bevredigend effect.